El Lycée Alliance Française Antoine de Saint Exupéry es administrado por la “Corporación educacional Alianza francesa de Santiago”, que no tiene fines de lucro y busca contribuir al desarrollo educacional del país, de acuerdo a la orientación general de la enseñanza oficial chilena, mediante el estudio de la lengua y de la cultura francesa, a través del esfuerzo conjunto de sus socios y en coordinación con profesores, padres de familia, alumnos y personal del colegio.
Son órganos de la administración de la Corporación: el Rector del Lycée de l’Alliance Francaise Antoine de Saint Exupéry, el Directorio y la Asamblea General de Socios.